Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB2BQ9BVA1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBB2BQ9BVA1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB2BQ9BVA1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms