Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRDL1Q9BU40 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRDL1Q9BU40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms