Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAGR1Q9BTK6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAGR1Q9BTK6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PAGR1Q9BTK6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms