Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COPS4Q9BT78 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COPS4Q9BT78 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms