Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYT17Q9BSW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SYT17Q9BSW7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYT17Q9BSW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYT17Q9BSW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SYT17Q9BSW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYT17Q9BSW7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
SYT17Q9BSW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYT17Q9BSW7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYT17Q9BSW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYT17Q9BSW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYT17Q9BSW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms