Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C2orf88Q9BSF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C2orf88Q9BSF0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C2orf88Q9BSF0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms