Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERP44Q9BS26 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERP44Q9BS26 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERP44Q9BS26 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms