Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SDF4Q9BRK5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDF4Q9BRK5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDF4Q9BRK5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms