Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQL6

FERMT1, Fermitin family homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT1Q9BQL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FERMT1Q9BQL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FERMT1Q9BQL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FERMT1Q9BQL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FERMT1Q9BQL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FERMT1Q9BQL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FERMT1Q9BQL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FERMT1Q9BQL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FERMT1Q9BQL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FERMT1Q9BQL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
FERMT1Q9BQL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms