Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHDC3Q9BQ90 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHDC3Q9BQ90 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHDC3Q9BQ90 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.8 ms