Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCF25Q9BQ70 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF25Q9BQ70 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF25Q9BQ70 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms