Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRRX2Q99811 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRRX2Q99811 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRRX2Q99811 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms