Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIGMAR1Q99720 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SIGMAR1Q99720 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIGMAR1Q99720 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms