Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPF18Q99633 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF18Q99633 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF18Q99633 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms