Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MMS19Q96T76 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MMS19Q96T76 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMS19Q96T76 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms