Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCCC1Q96RQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCCC1Q96RQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms