Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CITED4Q96RK1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED4Q96RK1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms