Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
LMTK3Q96Q04 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
LMTK3Q96Q04 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMTK3Q96Q04 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LMTK3Q96Q04 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms