Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCEEQ96PE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCEEQ96PE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCEEQ96PE7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms