Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP3Q96P47 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP3Q96P47 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP3Q96P47 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP3Q96P47 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms