Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC6Q96NY7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC6Q96NY7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms