Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU7

AMDHD1, Probable imidazolonepropionase, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMDHD1Q96NU7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMDHD1Q96NU7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMDHD1Q96NU7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMDHD1Q96NU7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms