Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU0

CNTNAP3B, Contactin-associated protein-like 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3BQ96NU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTNAP3BQ96NU0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP3BQ96NU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTNAP3BQ96NU0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms