Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC115Q96NT0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC115Q96NT0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC115Q96NT0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms