Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NSMCE3Q96MG7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSMCE3Q96MG7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE3Q96MG7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms