Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS50Q96JG6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS50Q96JG6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS50Q96JG6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms