Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM46AQ96IP4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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FAM46AQ96IP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM46AQ96IP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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