Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCMH1Q96GD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCMH1Q96GD3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms