Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMP6Q96FZ7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP6Q96FZ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms