Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX11Q96FC9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX11Q96FC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms