Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ERP27Q96DN0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERP27Q96DN0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERP27Q96DN0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms