Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC58Q96CX6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC58Q96CX6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms