Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRAMD1AQ96CP6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRAMD1AQ96CP6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms