Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC8Q96B26 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOSC8Q96B26 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms