Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC102AQ96A19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC102AQ96A19 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC102AQ96A19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms