Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXPE3Q969Y0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXPE3Q969Y0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXPE3Q969Y0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXPE3Q969Y0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms