Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA6Q92908 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA6Q92908 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATA6Q92908 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms