Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA4DQ92854 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4DQ92854 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms