Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PROX1Q92786 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PROX1Q92786 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms