Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDKL2Q92772 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKL2Q92772 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL2Q92772 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms