Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSPC1Q8WXF1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSPC1Q8WXF1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSPC1Q8WXF1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
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