Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC12Q8WVT3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC12Q8WVT3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC12Q8WVT3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms