Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG1Q8WTW3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COG1Q8WTW3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COG1Q8WTW3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms