Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSH3Q8TE77 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSH3Q8TE77 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SSH3Q8TE77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SSH3Q8TE77 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms