Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VN1R17PQ8TDU5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VN1R17PQ8TDU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VN1R17PQ8TDU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms