Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HELQQ8TDG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HELQQ8TDG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HELQQ8TDG4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms