Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MGARPQ8TDB4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MGARPQ8TDB4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms