Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBEAQ8NFP9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NBEAQ8NFP9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAQ8NFP9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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