Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A3Q8NEV1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms