Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APPL2Q8NEU8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APPL2Q8NEU8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APPL2Q8NEU8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APPL2Q8NEU8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms